Für den Einsatz von CometPA sind verschiedene Lizenzen erforderlich.
Die Software-Lizenz für Comet PA erlaubt den Einsatz der Lohnbuchhaltung auf der Basis der erworbenen Module. Diese Lizenz muss einmal pro Jahr bis zum 31. März aktualisiert werden. Die Lizenzkosten sind durch den Wartungsvertrag zwischen Kunden und HUP AG geregelt.
Die Elster-Lizenz ermöglicht die Kommunikation mit der Finanzverwaltung zur Abgabe von LSt-Anmeldungen und LSt-Bescheinigungen sowie das vollständige ELStAM-Meldeverfahren zur Verwaltung der Lohnsteuerabzugsmerkmale der Arbeitnehmer. Die Lizenz wird von der Finnazverwaltung über das Elster-Protal für drei Jahre vergeben. Abhängig von der gewählten Verschlüsselung zur Datenübertragung sind die Kosten gestaffelt. Für die gesicherte und verschlüsselte Datenübertragung aus der Lohnbuchhaltung kann eine kostenfreie Lizenz erlangt werden. Kostenpflichtige Lizenzen mit personengebundenen Zertifikaten werden von Comet PA unterstützt.
Das itsg-Zertifikat ist die Voraussetzung für die Kommunkikation mit allen Annahmestellen der Sozialversicherung und erlaubt dann den Versand und Empfang von Daten zu allen Meldeverfahren, die in der Comet PA Lizenz eingestellt sind. Das itsg-Zertifikat wird von einem zentralen Trust-Center bundesweit erteilt und gilt für drei Jahre. Das itsg-Zertifikat ist kostenpflichtig. Zum Jahreswechsle 2016 / 2017 betrugen die Kosten des Zertifikats 60,-- € für drei Jahre.
In der Lohnbuchhaltung Comet PA wird die Software Perfidia zur gesicherten und verschlüsselten Kommunikation mit den Annahmestellen der Sozialversicherung eingesetzt. Die Lizenzkosten dieser Software sind Bestandteil des Wartungsvertrags zwischen Kunden und HUP AG.